Наукові відділи
Відділ підприємництва, кооперації та агропромислової інтеграції
Відділ соціально-економічного розвитку сільських територій
Відділ організації менеджменту, публічного управління та адміністрування
Відділ економіки регіонального розвитку та прогнозування
Відділ земельних відносин та природокористування
Відділ інвестиційного та матеріально-технічного забезпечення
Відділ ціноутворення та аграрного ринку
Відділ організації наукових досліджень та інноваційного розвитку
Відділ економіки аграрного виробництва та міжнародної інтеграції
Відділ фінансово-кредитної та податкової політики
Відділ обліку та оподаткування
Сектор інформаційного забезпечення досліджень